I denne forbindelse har instituttets styre vedtatt en plan som beskrive hvilke strategiske vurderinger som planlegges, spesielt med hensyn til fremtidige oppgaver i de regionale enhetene, og arbeidsdeling mellom de regionale enhetene og hovedkontoret.
Planen bygger på Veterinærinstituttets rolle i den nasjonale matforvaltningen, og de oppgaver som instituttet ivaretar i forhold til Mattilsynets ansvar for nasjonal beredskap mot alvorlige dyre- og fiskesykdommer i Norge.