Noen desinfeksjonsmidler som brukes i vanlige husholdninger (Pyrisept), i sykehusmiljø, i matindustrien og i dyrehold generelt (Hipposan, Streptolin) er basert på virkestoffer (kvartære ammoniumforbindelser) som bakterier kan utvikle resistens mot.

Jostein Bjorland har studert resistens mot desinfeksjonsmidler hos stafylokokker som er forbundet med sykdom hos dyr, og oppdaget blant annet et nytt resistensgen i stafylokokker fra hest med infeksjon. Dette genet ble også funnet i stafylokokker fra upasteurisert tankmelk og fra kuer med jurbetennelse.

Bjorland påviste også utbredt forekomst av tidligere kjente resistensgener i stafylokokker fra ku og geit. En kobling mellom resistens mot penicillin og resistens mot desinfeksjonsmidler ble påvist i stafylokokker fra drøvtyggere. En slik kobling, som også er beskrevet for stafylokokker hos mennesker og i næringsmidler, innebærer at man ved ukritisk bruk av desinfeksjonsmidler samtidig kan øke forekomsten av bakterier som er resistente mot antibiotika.